RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514514.5

PAIP1-208, Transcript of poly(A) binding protein interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PAIP1, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1-208ENST00000514514 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.52■■■■■ 6.48
PAIP1-208ENST00000514514 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.66■■■■■ 5.38
PAIP1-208ENST00000514514 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
PAIP1-208ENST00000514514 ABCC9O60706 1549 aa46.2■■■■■ 4.99
PAIP1-208ENST00000514514 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.96■■■■■ 4.95
PAIP1-208ENST00000514514 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.76■■■■■ 4.92
PAIP1-208ENST00000514514 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.57■■■■■ 4.88
PAIP1-208ENST00000514514 NACADO15069 1562 aa45.36■■■■■ 4.85
PAIP1-208ENST00000514514 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.05■■■■■ 4.8
PAIP1-208ENST00000514514 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.89■■■■■ 4.78
PAIP1-208ENST00000514514 SCRIBQ14160 1630 aa44.6■■■■■ 4.73
PAIP1-208ENST00000514514 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.16■■■■■ 4.66
PAIP1-208ENST00000514514 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.71■■■■■ 4.59
PAIP1-208ENST00000514514 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.44■■■■■ 4.54
PAIP1-208ENST00000514514 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.13■■■■■ 4.49
PAIP1-208ENST00000514514 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
PAIP1-208ENST00000514514 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
PAIP1-208ENST00000514514 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
PAIP1-208ENST00000514514 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.86■■■■■ 4.45
PAIP1-208ENST00000514514 SMARCA4P51532 1647 aa42.77■■■■■ 4.44
PAIP1-208ENST00000514514 WIZO95785 1651 aa42.49■■■■■ 4.39
PAIP1-208ENST00000514514 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
PAIP1-208ENST00000514514 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.3■■■■■ 4.36
PAIP1-208ENST00000514514 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.13■■■■■ 4.34
PAIP1-208ENST00000514514 SMARCA2P51531 1590 aa42.12■■■■■ 4.33
PAIP1-208ENST00000514514 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
PAIP1-208ENST00000514514 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
PAIP1-208ENST00000514514 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.86■■■■■ 4.29
PAIP1-208ENST00000514514 NCAPD3P42695 1498 aa41.84■■■■■ 4.29
PAIP1-208ENST00000514514 HMGXB3Q12766 1538 aa41.79■■■■■ 4.28
PAIP1-208ENST00000514514 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.6■■■■■ 4.25
PAIP1-208ENST00000514514 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.04■■■■■ 4.16
PAIP1-208ENST00000514514 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.01■■■■■ 4.16
PAIP1-208ENST00000514514 CFTRP13569 1480 aa40.81■■■■■ 4.12
PAIP1-208ENST00000514514 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.71■■■■■ 4.11
PAIP1-208ENST00000514514 PRDM2Q13029 1718 aa40.66■■■■■ 4.1
PAIP1-208ENST00000514514 ABCC8Q09428 1581 aa40.59■■■■■ 4.09
PAIP1-208ENST00000514514 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.5■■■■■ 4.07
PAIP1-208ENST00000514514 TRIM41Q8WV44 630 aa40.47■■■■■ 4.07
PAIP1-208ENST00000514514 NESP48681 1621 aa40.46■■■■■ 4.07
PAIP1-208ENST00000514514 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.05
PAIP1-208ENST00000514514 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.27■■■■■ 4.04
PAIP1-208ENST00000514514 SYNJ1O43426 1573 aa40.26■■■■■ 4.04
PAIP1-208ENST00000514514 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.15■■■■■ 4.02
PAIP1-208ENST00000514514 TOP2BQ02880 1626 aa40.14■■■■■ 4.02
PAIP1-208ENST00000514514 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.14■■■■■ 4.02
PAIP1-208ENST00000514514 CUX1P39880 1505 aa40.11■■■■■ 4.01
PAIP1-208ENST00000514514 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.06■■■■■ 4
PAIP1-208ENST00000514514 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.03■■■■■ 4
PAIP1-208ENST00000514514 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.89■■■■□ 3.98
PAIP1-208ENST00000514514 TOPBP1Q92547 1522 aa39.81■■■■□ 3.96
PAIP1-208ENST00000514514 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
PAIP1-208ENST00000514514 SOGA1O94964 1423 aa39.73■■■■□ 3.95
PAIP1-208ENST00000514514 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.72■■■■□ 3.95
PAIP1-208ENST00000514514 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.68■■■■□ 3.94
PAIP1-208ENST00000514514 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
PAIP1-208ENST00000514514 ERCC6Q03468 1493 aa39.65■■■■□ 3.94
PAIP1-208ENST00000514514 EEA1Q15075 1411 aa39.64■■■■□ 3.94
PAIP1-208ENST00000514514 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.61■■■■□ 3.93
PAIP1-208ENST00000514514 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PAIP1-208ENST00000514514 WDR62O43379 1518 aa39.52■■■■□ 3.92
PAIP1-208ENST00000514514 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
PAIP1-208ENST00000514514 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.42■■■■□ 3.9
PAIP1-208ENST00000514514 KIF27Q86VH2 1401 aa39.39■■■■□ 3.9
PAIP1-208ENST00000514514 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.39■■■■□ 3.9
PAIP1-208ENST00000514514 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.38■■■■□ 3.89
PAIP1-208ENST00000514514 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.37■■■■□ 3.89
PAIP1-208ENST00000514514 CUX2O14529 1486 aa39.37■■■■□ 3.89
PAIP1-208ENST00000514514 WDR97A6NE52 1622 aa39.34■■■■□ 3.89
PAIP1-208ENST00000514514 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
PAIP1-208ENST00000514514 KIF21BO75037 1637 aa39.18■■■■□ 3.86
PAIP1-208ENST00000514514 IFT140Q96RY7 1462 aa39.14■■■■□ 3.86
PAIP1-208ENST00000514514 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.12■■■■□ 3.85
PAIP1-208ENST00000514514 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.07■■■■□ 3.85
PAIP1-208ENST00000514514 IGF1RP08069 1367 aa39.07■■■■□ 3.84
PAIP1-208ENST00000514514 PRXQ9BXM0 1461 aa39.07■■■■□ 3.84
PAIP1-208ENST00000514514 GOLGA3Q08378 1498 aa39.06■■■■□ 3.84
PAIP1-208ENST00000514514 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
PAIP1-208ENST00000514514 GAPVD1Q14C86 1478 aa39■■■■□ 3.83
PAIP1-208ENST00000514514 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.98■■■■□ 3.83
PAIP1-208ENST00000514514 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.96■■■■□ 3.83
PAIP1-208ENST00000514514 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
PAIP1-208ENST00000514514 CUL7Q14999 1698 aa38.88■■■■□ 3.81
PAIP1-208ENST00000514514 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.87■■■■□ 3.811e-7■■■■□ 26.5
PAIP1-208ENST00000514514 PBRM1Q86U86 1689 aa38.87■■■■□ 3.81
PAIP1-208ENST00000514514 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.86■■■■□ 3.81
PAIP1-208ENST00000514514 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.85■■■■□ 3.81
PAIP1-208ENST00000514514 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
PAIP1-208ENST00000514514 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
PAIP1-208ENST00000514514 GRIN2BQ13224 1484 aa38.76■■■■□ 3.8
PAIP1-208ENST00000514514 ADAMTS12P58397 1594 aa38.64■■■■□ 3.78
PAIP1-208ENST00000514514 CEP162Q5TB80 1403 aa38.61■■■■□ 3.77
PAIP1-208ENST00000514514 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.58■■■■□ 3.77
PAIP1-208ENST00000514514 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.54■■■■□ 3.76
PAIP1-208ENST00000514514 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
PAIP1-208ENST00000514514 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.4■■■■□ 3.74
PAIP1-208ENST00000514514 CLIP1P30622 1438 aa38.39■■■■□ 3.74
PAIP1-208ENST00000514514 SYNJ2O15056 1496 aa38.33■■■■□ 3.73
PAIP1-208ENST00000514514 GRIN2AQ12879 1464 aa38.3■■■■□ 3.72
PAIP1-208ENST00000514514 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms