Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV5-3A0A0A0MS03 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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