RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262631.10

SCN1B-201, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN1B, Length 1,670 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1B-201ENST00000262631 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.54■■■■■ 6.8
SCN1B-201ENST00000262631 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.63■■■■■ 5.7
SCN1B-201ENST00000262631 ABCC9O60706 1549 aa48.86■■■■■ 5.41
SCN1B-201ENST00000262631 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
SCN1B-201ENST00000262631 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.82■■■■■ 5.25
SCN1B-201ENST00000262631 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.57■■■■■ 5.21
SCN1B-201ENST00000262631 NACADO15069 1562 aa47.42■■■■■ 5.18
SCN1B-201ENST00000262631 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.41■■■■■ 5.18
SCN1B-201ENST00000262631 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.26■■■■■ 5.16
SCN1B-201ENST00000262631 SCRIBQ14160 1630 aa46.43■■■■■ 5.02
SCN1B-201ENST00000262631 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.23■■■■■ 4.99
SCN1B-201ENST00000262631 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.18■■■■■ 4.98
SCN1B-201ENST00000262631 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.89■■■■■ 4.94
SCN1B-201ENST00000262631 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.88■■■■■ 4.93
SCN1B-201ENST00000262631 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.82■■■■■ 4.77
SCN1B-201ENST00000262631 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
SCN1B-201ENST00000262631 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
SCN1B-201ENST00000262631 SMARCA4P51532 1647 aa44.44■■■■■ 4.7
SCN1B-201ENST00000262631 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.43■■■■■ 4.7
SCN1B-201ENST00000262631 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
SCN1B-201ENST00000262631 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.18■■■■■ 4.66
SCN1B-201ENST00000262631 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.1■■■■■ 4.65
SCN1B-201ENST00000262631 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44■■■■■ 4.63
SCN1B-201ENST00000262631 WIZO95785 1651 aa43.97■■■■■ 4.63
SCN1B-201ENST00000262631 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.96■■■■■ 4.63
SCN1B-201ENST00000262631 SMARCA2P51531 1590 aa43.92■■■■■ 4.62
SCN1B-201ENST00000262631 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
SCN1B-201ENST00000262631 NCAPD3P42695 1498 aa43.8■■■■■ 4.6
SCN1B-201ENST00000262631 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
SCN1B-201ENST00000262631 HMGXB3Q12766 1538 aa43.64■■■■■ 4.58
SCN1B-201ENST00000262631 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
SCN1B-201ENST00000262631 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.05■■■■■ 4.48
SCN1B-201ENST00000262631 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.6■■■■■ 4.41
SCN1B-201ENST00000262631 NESP48681 1621 aa42.58■■■■■ 4.41
SCN1B-201ENST00000262631 CFTRP13569 1480 aa42.55■■■■■ 4.4
SCN1B-201ENST00000262631 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.46■■■■■ 4.39
SCN1B-201ENST00000262631 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.16■■■■■ 4.34
SCN1B-201ENST00000262631 PRDM2Q13029 1718 aa42.15■■■■■ 4.34
SCN1B-201ENST00000262631 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.12■■■■■ 4.33
SCN1B-201ENST00000262631 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42■■■■■ 4.31
SCN1B-201ENST00000262631 ERCC6Q03468 1493 aa41.97■■■■■ 4.31
SCN1B-201ENST00000262631 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.95■■■■■ 4.31
SCN1B-201ENST00000262631 ABCC8Q09428 1581 aa41.8■■■■■ 4.28
SCN1B-201ENST00000262631 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.7■■■■■ 4.27
SCN1B-201ENST00000262631 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
SCN1B-201ENST00000262631 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.66■■■■■ 4.26
SCN1B-201ENST00000262631 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SCN1B-201ENST00000262631 CUX1P39880 1505 aa41.61■■■■■ 4.25
SCN1B-201ENST00000262631 TOPBP1Q92547 1522 aa41.55■■■■■ 4.24
SCN1B-201ENST00000262631 SYNJ1O43426 1573 aa41.53■■■■■ 4.24
SCN1B-201ENST00000262631 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.53■■■■■ 4.24
SCN1B-201ENST00000262631 WDR62O43379 1518 aa41.53■■■■■ 4.24
SCN1B-201ENST00000262631 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.48■■■■■ 4.23
SCN1B-201ENST00000262631 TOP2BQ02880 1626 aa41.43■■■■■ 4.22
SCN1B-201ENST00000262631 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.4■■■■■ 4.22
SCN1B-201ENST00000262631 TRIM41Q8WV44 630 aa41.33■■■■■ 4.21
SCN1B-201ENST00000262631 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.31■■■■■ 4.2
SCN1B-201ENST00000262631 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
SCN1B-201ENST00000262631 CUX2O14529 1486 aa41.2■■■■■ 4.19
SCN1B-201ENST00000262631 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.13■■■■■ 4.17
SCN1B-201ENST00000262631 SOGA1O94964 1423 aa41.11■■■■■ 4.17
SCN1B-201ENST00000262631 IFT140Q96RY7 1462 aa41.02■■■■■ 4.16
SCN1B-201ENST00000262631 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
SCN1B-201ENST00000262631 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.91■■■■■ 4.14
SCN1B-201ENST00000262631 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
SCN1B-201ENST00000262631 WDR97A6NE52 1622 aa40.86■■■■■ 4.13
SCN1B-201ENST00000262631 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
SCN1B-201ENST00000262631 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
SCN1B-201ENST00000262631 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.73■■■■■ 4.11
SCN1B-201ENST00000262631 KIF27Q86VH2 1401 aa40.69■■■■■ 4.1
SCN1B-201ENST00000262631 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.67■■■■■ 4.1
SCN1B-201ENST00000262631 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SCN1B-201ENST00000262631 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.64■■■■■ 4.1
SCN1B-201ENST00000262631 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
SCN1B-201ENST00000262631 GRIN2BQ13224 1484 aa40.49■■■■■ 4.07
SCN1B-201ENST00000262631 IGF1RP08069 1367 aa40.47■■■■■ 4.07
SCN1B-201ENST00000262631 EEA1Q15075 1411 aa40.46■■■■■ 4.07
SCN1B-201ENST00000262631 PBRM1Q86U86 1689 aa40.44■■■■■ 4.06
SCN1B-201ENST00000262631 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.41■■■■■ 4.06
SCN1B-201ENST00000262631 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.37■■■■■ 4.05
SCN1B-201ENST00000262631 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.35■■■■■ 4.05
SCN1B-201ENST00000262631 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
SCN1B-201ENST00000262631 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.23■■■■■ 4.03
SCN1B-201ENST00000262631 ADAMTS12P58397 1594 aa40.21■■■■■ 4.03
SCN1B-201ENST00000262631 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.19■■■■■ 4.02
SCN1B-201ENST00000262631 CUL7Q14999 1698 aa40.19■■■■■ 4.02
SCN1B-201ENST00000262631 PRXQ9BXM0 1461 aa40.18■■■■■ 4.02
SCN1B-201ENST00000262631 SYNJ2O15056 1496 aa40.12■■■■■ 4.01
SCN1B-201ENST00000262631 FBLN2P98095 1184 aa40.08■■■■■ 4.01
SCN1B-201ENST00000262631 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
SCN1B-201ENST00000262631 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.06■■■■■ 4
SCN1B-201ENST00000262631 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.02■■■■■ 4
SCN1B-201ENST00000262631 KIF21BO75037 1637 aa40■■■■□ 3.99
SCN1B-201ENST00000262631 GRIN2AQ12879 1464 aa39.99■■■■□ 3.99
SCN1B-201ENST00000262631 CHD1O14646 1710 aa39.95■■■■□ 3.99
SCN1B-201ENST00000262631 GOLGA3Q08378 1498 aa39.87■■■■□ 3.97
SCN1B-201ENST00000262631 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.86■■■■□ 3.97
SCN1B-201ENST00000262631 CEP170Q5SW79 1584 aa39.78■■■■□ 3.96
SCN1B-201ENST00000262631 NUP160Q12769 1436 aa39.77■■■■□ 3.96
SCN1B-201ENST00000262631 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms