Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM3Q9BZ71 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms