Protein–RNA interactions for Protein: O00178

GTPBP1, GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1O00178 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTPBP1O00178 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTPBP1O00178 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTPBP1O00178 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms