RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355904.8

GTF2E2-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E2, Length 1,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2-201ENST00000355904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.39■■■■■ 6.46
GTF2E2-201ENST00000355904 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.35■■■■■ 5.33
GTF2E2-201ENST00000355904 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
GTF2E2-201ENST00000355904 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.83■■■■■ 4.93
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCC9O60706 1549 aa45.69■■■■■ 4.9
GTF2E2-201ENST00000355904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.66■■■■■ 4.9
GTF2E2-201ENST00000355904 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.29■■■■■ 4.84
GTF2E2-201ENST00000355904 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.13■■■■■ 4.81
GTF2E2-201ENST00000355904 NACADO15069 1562 aa45.02■■■■■ 4.8
GTF2E2-201ENST00000355904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.64■■■■■ 4.74
GTF2E2-201ENST00000355904 SCRIBQ14160 1630 aa44.45■■■■■ 4.71
GTF2E2-201ENST00000355904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.72■■■■■ 4.59
GTF2E2-201ENST00000355904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
GTF2E2-201ENST00000355904 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.28■■■■■ 4.52
GTF2E2-201ENST00000355904 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.04■■■■■ 4.48
GTF2E2-201ENST00000355904 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.02■■■■■ 4.48
GTF2E2-201ENST00000355904 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
GTF2E2-201ENST00000355904 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
GTF2E2-201ENST00000355904 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.79■■■■■ 4.44
GTF2E2-201ENST00000355904 SMARCA4P51532 1647 aa42.6■■■■■ 4.41
GTF2E2-201ENST00000355904 WIZO95785 1651 aa42.44■■■■■ 4.38
GTF2E2-201ENST00000355904 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.09■■■■■ 4.33
GTF2E2-201ENST00000355904 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
GTF2E2-201ENST00000355904 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
GTF2E2-201ENST00000355904 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.89■■■■■ 4.3
GTF2E2-201ENST00000355904 SMARCA2P51531 1590 aa41.88■■■■■ 4.3
GTF2E2-201ENST00000355904 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
GTF2E2-201ENST00000355904 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.56■■■■■ 4.24
GTF2E2-201ENST00000355904 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.53■■■■■ 4.24
GTF2E2-201ENST00000355904 NCAPD3P42695 1498 aa41.53■■■■■ 4.24
GTF2E2-201ENST00000355904 HMGXB3Q12766 1538 aa41.51■■■■■ 4.24
GTF2E2-201ENST00000355904 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.36■■■■■ 4.21
GTF2E2-201ENST00000355904 TRIM41Q8WV44 630 aa40.8■■■■■ 4.12
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCC8Q09428 1581 aa40.69■■■■■ 4.1
GTF2E2-201ENST00000355904 CFTRP13569 1480 aa40.61■■■■■ 4.09
GTF2E2-201ENST00000355904 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.46■■■■■ 4.07
GTF2E2-201ENST00000355904 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
GTF2E2-201ENST00000355904 PRDM2Q13029 1718 aa40.43■■■■■ 4.06
GTF2E2-201ENST00000355904 SYNJ1O43426 1573 aa40.29■■■■■ 4.04
GTF2E2-201ENST00000355904 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.25■■■■■ 4.03
GTF2E2-201ENST00000355904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.14■■■■■ 4.02
GTF2E2-201ENST00000355904 TOP2BQ02880 1626 aa40.13■■■■■ 4.01
GTF2E2-201ENST00000355904 NESP48681 1621 aa40.11■■■■■ 4.01
GTF2E2-201ENST00000355904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.1■■■■■ 4.01
GTF2E2-201ENST00000355904 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
GTF2E2-201ENST00000355904 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.03■■■■■ 4
GTF2E2-201ENST00000355904 CUX1P39880 1505 aa40.03■■■■■ 4
GTF2E2-201ENST00000355904 SOGA1O94964 1423 aa39.91■■■■□ 3.98
GTF2E2-201ENST00000355904 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.9■■■■□ 3.98
GTF2E2-201ENST00000355904 EEA1Q15075 1411 aa39.87■■■■□ 3.97
GTF2E2-201ENST00000355904 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.81■■■■□ 3.96
GTF2E2-201ENST00000355904 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.79■■■■□ 3.96
GTF2E2-201ENST00000355904 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.74■■■■□ 3.95
GTF2E2-201ENST00000355904 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.69■■■■□ 3.94
GTF2E2-201ENST00000355904 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.65■■■■□ 3.94
GTF2E2-201ENST00000355904 TOPBP1Q92547 1522 aa39.6■■■■□ 3.93
GTF2E2-201ENST00000355904 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.59■■■■□ 3.93
GTF2E2-201ENST00000355904 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.59■■■■□ 3.93
GTF2E2-201ENST00000355904 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
GTF2E2-201ENST00000355904 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.46■■■■□ 3.91
GTF2E2-201ENST00000355904 KIF27Q86VH2 1401 aa39.42■■■■□ 3.9
GTF2E2-201ENST00000355904 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
GTF2E2-201ENST00000355904 KIF21BO75037 1637 aa39.36■■■■□ 3.89
GTF2E2-201ENST00000355904 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.33■■■■□ 3.89
GTF2E2-201ENST00000355904 CUX2O14529 1486 aa39.32■■■■□ 3.89
GTF2E2-201ENST00000355904 GOLGA3Q08378 1498 aa39.32■■■■□ 3.88
GTF2E2-201ENST00000355904 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.25■■■■□ 3.87
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.25■■■■□ 3.87
GTF2E2-201ENST00000355904 ERCC6Q03468 1493 aa39.2■■■■□ 3.87
GTF2E2-201ENST00000355904 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.16■■■■□ 3.86
GTF2E2-201ENST00000355904 PRXQ9BXM0 1461 aa39.15■■■■□ 3.86
GTF2E2-201ENST00000355904 WDR97A6NE52 1622 aa39.14■■■■□ 3.86
GTF2E2-201ENST00000355904 WDR62O43379 1518 aa39.13■■■■□ 3.85
GTF2E2-201ENST00000355904 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.11■■■■□ 3.85
GTF2E2-201ENST00000355904 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.1■■■■□ 3.85
GTF2E2-201ENST00000355904 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
GTF2E2-201ENST00000355904 IGF1RP08069 1367 aa39.04■■■■□ 3.84
GTF2E2-201ENST00000355904 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
GTF2E2-201ENST00000355904 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.83
GTF2E2-201ENST00000355904 CEP162Q5TB80 1403 aa38.97■■■■□ 3.83
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.94■■■■□ 3.82
GTF2E2-201ENST00000355904 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.86■■■■□ 3.81
GTF2E2-201ENST00000355904 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
GTF2E2-201ENST00000355904 IFT140Q96RY7 1462 aa38.84■■■■□ 3.81
GTF2E2-201ENST00000355904 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.83■■■■□ 3.81
GTF2E2-201ENST00000355904 CUL7Q14999 1698 aa38.81■■■■□ 3.8
GTF2E2-201ENST00000355904 CLIP1P30622 1438 aa38.67■■■■□ 3.78
GTF2E2-201ENST00000355904 PBRM1Q86U86 1689 aa38.65■■■■□ 3.78
GTF2E2-201ENST00000355904 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.62■■■■□ 3.77
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
GTF2E2-201ENST00000355904 GRIN2BQ13224 1484 aa38.55■■■■□ 3.76
GTF2E2-201ENST00000355904 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
GTF2E2-201ENST00000355904 ADAMTS12P58397 1594 aa38.45■■■■□ 3.75
GTF2E2-201ENST00000355904 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
GTF2E2-201ENST00000355904 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.43■■■■□ 3.74
GTF2E2-201ENST00000355904 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.36■■■■□ 3.73
GTF2E2-201ENST00000355904 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.34■■■■□ 3.73
GTF2E2-201ENST00000355904 ARAP1Q96P48 1450 aa38.31■■■■□ 3.72
GTF2E2-201ENST00000355904 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.3■■■■□ 3.72
GTF2E2-201ENST00000355904 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms