Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP3Q9Y446 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKP3Q9Y446 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms