Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX4Q969G2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX4Q969G2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX4Q969G2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms