Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA1Q8N8W4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA1Q8N8W4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA1Q8N8W4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA1Q8N8W4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA1Q8N8W4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA1Q8N8W4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA1Q8N8W4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms