Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAMP11215 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAMP11215 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms