Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.73■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ARHGAP35Q9NRY4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.63■■■■□ 3.94
ARHGAP35Q9NRY4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ARHGAP35Q9NRY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ARHGAP35Q9NRY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC39.51■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARHGAP35Q9NRY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms