Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO6Q9NRD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO6Q9NRD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms