Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CD93Q9NPY3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD93Q9NPY3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CD93Q9NPY3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD93Q9NPY3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms