Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMYD4Q8IYR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMYD4Q8IYR2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMYD4Q8IYR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMYD4Q8IYR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMYD4Q8IYR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMYD4Q8IYR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMYD4Q8IYR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMYD4Q8IYR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMYD4Q8IYR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMYD4Q8IYR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD4Q8IYR2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms