RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580022.5

TSPOAP1-AS1-205, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,337 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.52■■■■■ 6
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.24■■■■■ 4.83
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.86■■■■■ 4.61
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.55■■■■■ 4.56
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.21■■■■■ 4.51
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.4
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCC9O60706 1549 aa42.46■■■■■ 4.39
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.34■■■■■ 4.37
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SCRIBQ14160 1630 aa42.07■■■■■ 4.32
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NACADO15069 1562 aa41.99■■■■■ 4.31
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.5■■■■■ 4.23
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CHIC1Q5VXU3 224 aa41■■■■■ 4.15
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.92■■■■■ 4.14
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.84■■■■■ 4.13
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.73■■■■■ 4.11
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 WIZO95785 1651 aa40.47■■■■■ 4.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.33■■■■■ 4.05
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.05
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SMARCA4P51532 1647 aa40.22■■■■■ 4.03
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRIM41Q8WV44 630 aa39.8■■■■□ 3.96
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.65■■■■□ 3.94
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.62■■■■□ 3.93
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SMARCA2P51531 1590 aa39.62■■■■□ 3.93
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.55■■■■□ 3.92
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.37■■■■□ 3.89
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCC8Q09428 1581 aa39.19■■■■□ 3.86
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HRCP23327 699 aa39.01■■■■□ 3.83
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.94■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NCAPD3P42695 1498 aa38.8■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HMGXB3Q12766 1538 aa38.78■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.69■■■■□ 3.78
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.69■■■■□ 3.78
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SOGA1O94964 1423 aa38.61■■■■□ 3.77
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SYNJ1O43426 1573 aa38.55■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.45■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 EEA1Q15075 1411 aa38.39■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.32■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.32■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CFTRP13569 1480 aa38.22■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TOP2BQ02880 1626 aa38.21■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.12■■■■□ 3.69
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.06■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GOLGA3Q08378 1498 aa38.04■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CEP162Q5TB80 1403 aa38.03■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CUX1P39880 1505 aa38■■■■□ 3.67
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PRDM2Q13029 1718 aa37.99■■■■□ 3.67
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.95■■■■□ 3.67
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.94■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KIF21BO75037 1637 aa37.92■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.74■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KIF27Q86VH2 1401 aa37.6■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.59■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NESP48681 1621 aa37.55■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PRXQ9BXM0 1461 aa37.53■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CLIP1P30622 1438 aa37.53■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.49■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.47■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CUX2O14529 1486 aa37.41■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.4■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.34■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.31■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.26■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TOPBP1Q92547 1522 aa37.25■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IGF1RP08069 1367 aa37.23■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.15■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.08■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.06■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ARAP1Q96P48 1450 aa37.05■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.05■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 APLP2Q06481 763 aa37.01■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.89■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 WDR97A6NE52 1622 aa36.85■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CUL7Q14999 1698 aa36.74■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.64■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.58■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.53■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 P3H3Q8IVL6 736 aa36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms