Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP6Q6ZN66 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
GBP6Q6ZN66 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GBP6Q6ZN66 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms