Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRCAPQ14761 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAPQ14761 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRCAPQ14761 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCAPQ14761 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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