Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RRP1BQ14684 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRP1BQ14684 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP1BQ14684 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RRP1BQ14684 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RRP1BQ14684 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
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