Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EIF4A3P38919 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF4A3P38919 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms