RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409400.1

BIN1-211, Transcript of bridging integrator 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BIN1, Length 2,143 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1-211ENST00000409400 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.35■■■■■ 6.29
BIN1-211ENST00000409400 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.23■■■■■ 5.15
BIN1-211ENST00000409400 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.9
BIN1-211ENST00000409400 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.9■■■■■ 4.78
BIN1-211ENST00000409400 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.89■■■■■ 4.78
BIN1-211ENST00000409400 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.57■■■■■ 4.73
BIN1-211ENST00000409400 ABCC9O60706 1549 aa44.57■■■■■ 4.73
BIN1-211ENST00000409400 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.27■■■■■ 4.68
BIN1-211ENST00000409400 NACADO15069 1562 aa43.96■■■■■ 4.63
BIN1-211ENST00000409400 SCRIBQ14160 1630 aa43.54■■■■■ 4.56
BIN1-211ENST00000409400 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.53■■■■■ 4.56
BIN1-211ENST00000409400 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
BIN1-211ENST00000409400 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.72■■■■■ 4.43
BIN1-211ENST00000409400 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.27■■■■■ 4.36
BIN1-211ENST00000409400 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
BIN1-211ENST00000409400 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.26■■■■■ 4.36
BIN1-211ENST00000409400 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
BIN1-211ENST00000409400 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.03■■■■■ 4.32
BIN1-211ENST00000409400 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
BIN1-211ENST00000409400 SMARCA4P51532 1647 aa41.73■■■■■ 4.27
BIN1-211ENST00000409400 WIZO95785 1651 aa41.7■■■■■ 4.27
BIN1-211ENST00000409400 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.26■■■■■ 4.19
BIN1-211ENST00000409400 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
BIN1-211ENST00000409400 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.19■■■■■ 4.18
BIN1-211ENST00000409400 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41■■■■■ 4.15
BIN1-211ENST00000409400 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
BIN1-211ENST00000409400 SMARCA2P51531 1590 aa40.95■■■■■ 4.15
BIN1-211ENST00000409400 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.85■■■■■ 4.13
BIN1-211ENST00000409400 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
BIN1-211ENST00000409400 NCAPD3P42695 1498 aa40.6■■■■■ 4.09
BIN1-211ENST00000409400 HMGXB3Q12766 1538 aa40.54■■■■■ 4.08
BIN1-211ENST00000409400 TRIM41Q8WV44 630 aa40.37■■■■■ 4.05
BIN1-211ENST00000409400 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.32■■■■■ 4.04
BIN1-211ENST00000409400 ABCC8Q09428 1581 aa40.08■■■■■ 4.01
BIN1-211ENST00000409400 CFTRP13569 1480 aa39.77■■■■□ 3.96
BIN1-211ENST00000409400 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.77■■■■□ 3.96
BIN1-211ENST00000409400 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.73■■■■□ 3.95
BIN1-211ENST00000409400 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
BIN1-211ENST00000409400 SYNJ1O43426 1573 aa39.61■■■■□ 3.93
BIN1-211ENST00000409400 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.6■■■■□ 3.93
BIN1-211ENST00000409400 PRDM2Q13029 1718 aa39.54■■■■□ 3.92
BIN1-211ENST00000409400 TOP2BQ02880 1626 aa39.41■■■■□ 3.9
BIN1-211ENST00000409400 SOGA1O94964 1423 aa39.38■■■■□ 3.9
BIN1-211ENST00000409400 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.35■■■■□ 3.89
BIN1-211ENST00000409400 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.34■■■■□ 3.89
BIN1-211ENST00000409400 CUX1P39880 1505 aa39.27■■■■□ 3.88
BIN1-211ENST00000409400 EEA1Q15075 1411 aa39.26■■■■□ 3.88
BIN1-211ENST00000409400 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.24■■■■□ 3.87
BIN1-211ENST00000409400 NESP48681 1621 aa39.22■■■■□ 3.87
BIN1-211ENST00000409400 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.16■■■■□ 3.86
BIN1-211ENST00000409400 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.16■■■■□ 3.86
BIN1-211ENST00000409400 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.15■■■■□ 3.86
BIN1-211ENST00000409400 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.11■■■■□ 3.85
BIN1-211ENST00000409400 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.87■■■■□ 3.81
BIN1-211ENST00000409400 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.87■■■■□ 3.81
BIN1-211ENST00000409400 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.82■■■■□ 3.81
BIN1-211ENST00000409400 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.81■■■■□ 3.8
BIN1-211ENST00000409400 GOLGA3Q08378 1498 aa38.76■■■■□ 3.8
BIN1-211ENST00000409400 KIF21BO75037 1637 aa38.76■■■■□ 3.8
BIN1-211ENST00000409400 TOPBP1Q92547 1522 aa38.76■■■■□ 3.79
BIN1-211ENST00000409400 KIF27Q86VH2 1401 aa38.73■■■■□ 3.79
BIN1-211ENST00000409400 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.71■■■■□ 3.79
BIN1-211ENST00000409400 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.7■■■■□ 3.79
BIN1-211ENST00000409400 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
BIN1-211ENST00000409400 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.78
BIN1-211ENST00000409400 CUX2O14529 1486 aa38.6■■■■□ 3.77
BIN1-211ENST00000409400 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
BIN1-211ENST00000409400 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.56■■■■□ 3.76
BIN1-211ENST00000409400 PRXQ9BXM0 1461 aa38.54■■■■□ 3.76
BIN1-211ENST00000409400 CEP162Q5TB80 1403 aa38.52■■■■□ 3.76
BIN1-211ENST00000409400 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.5■■■■□ 3.75
BIN1-211ENST00000409400 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.46■■■■□ 3.75
BIN1-211ENST00000409400 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.46■■■■□ 3.75
BIN1-211ENST00000409400 IGF1RP08069 1367 aa38.41■■■■□ 3.74
BIN1-211ENST00000409400 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.36■■■■□ 3.73
BIN1-211ENST00000409400 WDR97A6NE52 1622 aa38.3■■■■□ 3.72
BIN1-211ENST00000409400 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.2■■■■□ 3.71
BIN1-211ENST00000409400 CLIP1P30622 1438 aa38.17■■■■□ 3.7
BIN1-211ENST00000409400 ERCC6Q03468 1493 aa38.16■■■■□ 3.7
BIN1-211ENST00000409400 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
BIN1-211ENST00000409400 WDR62O43379 1518 aa38.15■■■■□ 3.7
BIN1-211ENST00000409400 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.12■■■■□ 3.69
BIN1-211ENST00000409400 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
BIN1-211ENST00000409400 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.11■■■■□ 3.69
BIN1-211ENST00000409400 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.04■■■■□ 3.68
BIN1-211ENST00000409400 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
BIN1-211ENST00000409400 CUL7Q14999 1698 aa38.02■■■■□ 3.68
BIN1-211ENST00000409400 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
BIN1-211ENST00000409400 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
BIN1-211ENST00000409400 IFT140Q96RY7 1462 aa37.92■■■■□ 3.66
BIN1-211ENST00000409400 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
BIN1-211ENST00000409400 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.85■■■■□ 3.65
BIN1-211ENST00000409400 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.83■■■■□ 3.65
BIN1-211ENST00000409400 PBRM1Q86U86 1689 aa37.8■■■■□ 3.64
BIN1-211ENST00000409400 ARAP1Q96P48 1450 aa37.78■■■■□ 3.64
BIN1-211ENST00000409400 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
BIN1-211ENST00000409400 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.74■■■■□ 3.63
BIN1-211ENST00000409400 GRIN2BQ13224 1484 aa37.7■■■■□ 3.63
BIN1-211ENST00000409400 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.65■■■■□ 3.62
BIN1-211ENST00000409400 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.63■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms