RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574882.5

TSPAN10-203, Transcript of tetraspanin 10, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN10, Length 1,837 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN10-203ENST00000574882 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.33■■■■■ 6.45
TSPAN10-203ENST00000574882 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.36■■■■■ 5.33
TSPAN10-203ENST00000574882 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
TSPAN10-203ENST00000574882 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.8■■■■■ 4.92
TSPAN10-203ENST00000574882 ABCC9O60706 1549 aa45.58■■■■■ 4.89
TSPAN10-203ENST00000574882 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.55■■■■■ 4.88
TSPAN10-203ENST00000574882 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.26■■■■■ 4.84
TSPAN10-203ENST00000574882 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.03■■■■■ 4.8
TSPAN10-203ENST00000574882 NACADO15069 1562 aa44.98■■■■■ 4.79
TSPAN10-203ENST00000574882 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.6■■■■■ 4.73
TSPAN10-203ENST00000574882 SCRIBQ14160 1630 aa44.39■■■■■ 4.7
TSPAN10-203ENST00000574882 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.78■■■■■ 4.6
TSPAN10-203ENST00000574882 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
TSPAN10-203ENST00000574882 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.24■■■■■ 4.51
TSPAN10-203ENST00000574882 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.94■■■■■ 4.47
TSPAN10-203ENST00000574882 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.46
TSPAN10-203ENST00000574882 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.46
TSPAN10-203ENST00000574882 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
TSPAN10-203ENST00000574882 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.73■■■■■ 4.43
TSPAN10-203ENST00000574882 SMARCA4P51532 1647 aa42.58■■■■■ 4.41
TSPAN10-203ENST00000574882 WIZO95785 1651 aa42.42■■■■■ 4.38
TSPAN10-203ENST00000574882 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.07■■■■■ 4.32
TSPAN10-203ENST00000574882 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
TSPAN10-203ENST00000574882 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
TSPAN10-203ENST00000574882 SMARCA2P51531 1590 aa41.86■■■■■ 4.29
TSPAN10-203ENST00000574882 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.81■■■■■ 4.28
TSPAN10-203ENST00000574882 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
TSPAN10-203ENST00000574882 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.49■■■■■ 4.23
TSPAN10-203ENST00000574882 HMGXB3Q12766 1538 aa41.47■■■■■ 4.23
TSPAN10-203ENST00000574882 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.47■■■■■ 4.23
TSPAN10-203ENST00000574882 NCAPD3P42695 1498 aa41.46■■■■■ 4.23
TSPAN10-203ENST00000574882 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.31■■■■■ 4.2
TSPAN10-203ENST00000574882 TRIM41Q8WV44 630 aa40.74■■■■■ 4.11
TSPAN10-203ENST00000574882 ABCC8Q09428 1581 aa40.65■■■■■ 4.1
TSPAN10-203ENST00000574882 CFTRP13569 1480 aa40.55■■■■■ 4.08
TSPAN10-203ENST00000574882 PRDM2Q13029 1718 aa40.51■■■■■ 4.08
TSPAN10-203ENST00000574882 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.06
TSPAN10-203ENST00000574882 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.38■■■■■ 4.05
TSPAN10-203ENST00000574882 SYNJ1O43426 1573 aa40.25■■■■■ 4.03
TSPAN10-203ENST00000574882 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.12■■■■■ 4.01
TSPAN10-203ENST00000574882 TOP2BQ02880 1626 aa40.11■■■■■ 4.01
TSPAN10-203ENST00000574882 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.11■■■■■ 4.01
TSPAN10-203ENST00000574882 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.11■■■■■ 4.01
TSPAN10-203ENST00000574882 NESP48681 1621 aa40.03■■■■■ 4
TSPAN10-203ENST00000574882 CUX1P39880 1505 aa39.97■■■■□ 3.99
TSPAN10-203ENST00000574882 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
TSPAN10-203ENST00000574882 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.96■■■■□ 3.99
TSPAN10-203ENST00000574882 EEA1Q15075 1411 aa39.84■■■■□ 3.97
TSPAN10-203ENST00000574882 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.84■■■■□ 3.97
TSPAN10-203ENST00000574882 SOGA1O94964 1423 aa39.83■■■■□ 3.97
TSPAN10-203ENST00000574882 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.74■■■■□ 3.95
TSPAN10-203ENST00000574882 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.74■■■■□ 3.95
TSPAN10-203ENST00000574882 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.68■■■■□ 3.94
TSPAN10-203ENST00000574882 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.65■■■■□ 3.94
TSPAN10-203ENST00000574882 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.65■■■■□ 3.94
TSPAN10-203ENST00000574882 TOPBP1Q92547 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
TSPAN10-203ENST00000574882 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.53■■■■□ 3.92
TSPAN10-203ENST00000574882 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.53■■■■□ 3.92
TSPAN10-203ENST00000574882 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
TSPAN10-203ENST00000574882 KIF27Q86VH2 1401 aa39.37■■■■□ 3.89
TSPAN10-203ENST00000574882 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.36■■■■□ 3.89
TSPAN10-203ENST00000574882 KIF21BO75037 1637 aa39.36■■■■□ 3.89
TSPAN10-203ENST00000574882 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
TSPAN10-203ENST00000574882 GOLGA3Q08378 1498 aa39.28■■■■□ 3.88
TSPAN10-203ENST00000574882 CUX2O14529 1486 aa39.26■■■■□ 3.88
TSPAN10-203ENST00000574882 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.26■■■■□ 3.88
TSPAN10-203ENST00000574882 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.19■■■■□ 3.86
TSPAN10-203ENST00000574882 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.17■■■■□ 3.86
TSPAN10-203ENST00000574882 WDR97A6NE52 1622 aa39.15■■■■□ 3.86
TSPAN10-203ENST00000574882 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.12■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 ERCC6Q03468 1493 aa39.11■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 PRXQ9BXM0 1461 aa39.1■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.09■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 WDR62O43379 1518 aa39.08■■■■□ 3.85
TSPAN10-203ENST00000574882 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.05■■■■□ 3.84
TSPAN10-203ENST00000574882 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
TSPAN10-203ENST00000574882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
TSPAN10-203ENST00000574882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
TSPAN10-203ENST00000574882 IGF1RP08069 1367 aa38.97■■■■□ 3.83
TSPAN10-203ENST00000574882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.92■■■■□ 3.82
TSPAN10-203ENST00000574882 CEP162Q5TB80 1403 aa38.92■■■■□ 3.82
TSPAN10-203ENST00000574882 CUL7Q14999 1698 aa38.81■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.79■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.78■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 IFT140Q96RY7 1462 aa38.78■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
TSPAN10-203ENST00000574882 PBRM1Q86U86 1689 aa38.67■■■■□ 3.78
TSPAN10-203ENST00000574882 CLIP1P30622 1438 aa38.62■■■■□ 3.77
TSPAN10-203ENST00000574882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.53■■■■□ 3.76
TSPAN10-203ENST00000574882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
TSPAN10-203ENST00000574882 GRIN2BQ13224 1484 aa38.49■■■■□ 3.75
TSPAN10-203ENST00000574882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
TSPAN10-203ENST00000574882 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.42■■■■□ 3.74
TSPAN10-203ENST00000574882 ADAMTS12P58397 1594 aa38.41■■■■□ 3.74
TSPAN10-203ENST00000574882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.36■■■■□ 3.73
TSPAN10-203ENST00000574882 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
TSPAN10-203ENST00000574882 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.3■■■■□ 3.72
TSPAN10-203ENST00000574882 ARAP1Q96P48 1450 aa38.26■■■■□ 3.71
TSPAN10-203ENST00000574882 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.25■■■■□ 3.71
TSPAN10-203ENST00000574882 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.23■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms