Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJC1P36383 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJC1P36383 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJC1P36383 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJC1P36383 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJC1P36383 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJC1P36383 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJC1P36383 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJC1P36383 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJC1P36383 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJC1P36383 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJC1P36383 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GJC1P36383 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJC1P36383 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJC1P36383 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJC1P36383 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJC1P36383 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJC1P36383 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJC1P36383 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJC1P36383 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJC1P36383 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJC1P36383 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJC1P36383 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJC1P36383 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJC1P36383 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJC1P36383 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJC1P36383 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJC1P36383 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJC1P36383 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJC1P36383 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJC1P36383 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJC1P36383 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJC1P36383 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJC1P36383 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJC1P36383 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJC1P36383 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJC1P36383 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJC1P36383 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJC1P36383 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJC1P36383 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJC1P36383 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJC1P36383 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJC1P36383 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJC1P36383 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJC1P36383 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJC1P36383 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJC1P36383 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJC1P36383 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJC1P36383 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJC1P36383 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJC1P36383 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJC1P36383 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJC1P36383 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJC1P36383 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJC1P36383 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJC1P36383 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJC1P36383 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GJC1P36383 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJC1P36383 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJC1P36383 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJC1P36383 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJC1P36383 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJC1P36383 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJC1P36383 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJC1P36383 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJC1P36383 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJC1P36383 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJC1P36383 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJC1P36383 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJC1P36383 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJC1P36383 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJC1P36383 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJC1P36383 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJC1P36383 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJC1P36383 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJC1P36383 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJC1P36383 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJC1P36383 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJC1P36383 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJC1P36383 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJC1P36383 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJC1P36383 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJC1P36383 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJC1P36383 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms