Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP6P35125 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP6P35125 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
USP6P35125 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP6P35125 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP6P35125 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP6P35125 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP6P35125 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP6P35125 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP6P35125 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP6P35125 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP6P35125 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP6P35125 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
USP6P35125 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP6P35125 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP6P35125 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP6P35125 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP6P35125 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP6P35125 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP6P35125 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP6P35125 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP6P35125 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP6P35125 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP6P35125 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP6P35125 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP6P35125 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP6P35125 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP6P35125 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP6P35125 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP6P35125 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP6P35125 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP6P35125 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP6P35125 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP6P35125 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP6P35125 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP6P35125 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP6P35125 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP6P35125 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
USP6P35125 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP6P35125 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP6P35125 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
USP6P35125 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP6P35125 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP6P35125 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP6P35125 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP6P35125 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
USP6P35125 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP6P35125 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP6P35125 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP6P35125 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP6P35125 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP6P35125 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
USP6P35125 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
USP6P35125 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP6P35125 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP6P35125 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP6P35125 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
USP6P35125 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP6P35125 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP6P35125 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP6P35125 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP6P35125 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP6P35125 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP6P35125 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP6P35125 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP6P35125 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP6P35125 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP6P35125 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP6P35125 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP6P35125 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP6P35125 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP6P35125 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP6P35125 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP6P35125 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP6P35125 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP6P35125 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP6P35125 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP6P35125 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP6P35125 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
USP6P35125 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
USP6P35125 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP6P35125 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP6P35125 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
USP6P35125 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP6P35125 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP6P35125 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP6P35125 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP6P35125 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP6P35125 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP6P35125 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP6P35125 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP6P35125 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP6P35125 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP6P35125 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
USP6P35125 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
USP6P35125 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
USP6P35125 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
USP6P35125 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
USP6P35125 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
USP6P35125 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms