RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515209.5

LMAN2-208, Transcript of lectin, mannose binding 2, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene LMAN2, Length 1,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMAN2-208	ENST00000515209	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.62	■■■■■ 6.98
LMAN2-208	ENST00000515209	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.26	■■■■■ 5.96
LMAN2-208	ENST00000515209	ABCC9	O60706	1549 aa		50.92	■■■■■ 5.74
LMAN2-208	ENST00000515209	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.09	■■■■■ 5.45
LMAN2-208	ENST00000515209	NACAD	O15069	1562 aa		49.03	■■■■■ 5.44
LMAN2-208	ENST00000515209	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.87	■■■■■ 5.41
LMAN2-208	ENST00000515209	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.8	■■■■■ 5.4
LMAN2-208	ENST00000515209	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		48.65	■■■■■ 5.38
LMAN2-208	ENST00000515209	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.58	■■■■■ 5.37
LMAN2-208	ENST00000515209	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.14	■■■■■ 5.3
LMAN2-208	ENST00000515209	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		47.66	■■■■■ 5.22
LMAN2-208	ENST00000515209	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.56	■■■■■ 5.2
LMAN2-208	ENST00000515209	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.48	■■■■■ 5.19
LMAN2-208	ENST00000515209	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.17	■■■■■ 5.14
LMAN2-208	ENST00000515209	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.72	■■■■■ 5.07
LMAN2-208	ENST00000515209	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.36	■■■■■ 5.01
LMAN2-208	ENST00000515209	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.17	■■■■■ 4.98
LMAN2-208	ENST00000515209	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.78	■■■■■ 4.92
LMAN2-208	ENST00000515209	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.54	■■■■■ 4.88
LMAN2-208	ENST00000515209	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.45	■■■■■ 4.87
LMAN2-208	ENST00000515209	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.23	■■■■■ 4.83
LMAN2-208	ENST00000515209	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.21	■■■■■ 4.83
LMAN2-208	ENST00000515209	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.2	■■■■■ 4.83
LMAN2-208	ENST00000515209	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.17	■■■■■ 4.82
LMAN2-208	ENST00000515209	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.14	■■■■■ 4.82
LMAN2-208	ENST00000515209	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.06	■■■■■ 4.8
LMAN2-208	ENST00000515209	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	44.83	■■■■■ 4.77
LMAN2-208	ENST00000515209	WIZ	O95785	1651 aa		44.71	■■■■■ 4.75
LMAN2-208	ENST00000515209	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.6	■■■■■ 4.73
LMAN2-208	ENST00000515209	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.24	■■■■■ 4.67
LMAN2-208	ENST00000515209	NES	P48681	1621 aa		44.1	■■■■■ 4.65
LMAN2-208	ENST00000515209	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.07	■■■■■ 4.65
LMAN2-208	ENST00000515209	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.87	■■■■■ 4.61
LMAN2-208	ENST00000515209	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.83	■■■■■ 4.61
LMAN2-208	ENST00000515209	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.71	■■■■■ 4.59
LMAN2-208	ENST00000515209	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.66	■■■■■ 4.58
LMAN2-208	ENST00000515209	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.65	■■■■■ 4.58
LMAN2-208	ENST00000515209	CFTR	P13569	1480 aa		43.64	■■■■■ 4.58
LMAN2-208	ENST00000515209	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.57	■■■■■ 4.57
LMAN2-208	ENST00000515209	CUX2	O14529	1486 aa		43.52	■■■■■ 4.56
LMAN2-208	ENST00000515209	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.51	■■■■■ 4.56
LMAN2-208	ENST00000515209	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.36	■■■■■ 4.53
LMAN2-208	ENST00000515209	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.32	■■■■■ 4.52
LMAN2-208	ENST00000515209	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.27	■■■■■ 4.52
LMAN2-208	ENST00000515209	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
LMAN2-208	ENST00000515209	WDR62	O43379	1518 aa		43.19	■■■■■ 4.5
LMAN2-208	ENST00000515209	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
LMAN2-208	ENST00000515209	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LMAN2-208	ENST00000515209	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LMAN2-208	ENST00000515209	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.67	■■■■■ 4.42
LMAN2-208	ENST00000515209	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.42	■■■■■ 4.38
LMAN2-208	ENST00000515209	CUX1	P39880	1505 aa		42.39	■■■■■ 4.38
LMAN2-208	ENST00000515209	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
LMAN2-208	ENST00000515209	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
LMAN2-208	ENST00000515209	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
LMAN2-208	ENST00000515209	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.21	■■■■■ 4.35
LMAN2-208	ENST00000515209	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
LMAN2-208	ENST00000515209	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.1	■■■■■ 4.33
LMAN2-208	ENST00000515209	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.1	■■■■■ 4.33
LMAN2-208	ENST00000515209	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.08	■■■■■ 4.33
LMAN2-208	ENST00000515209	SOGA1	O94964	1423 aa		42.07	■■■■■ 4.33
LMAN2-208	ENST00000515209	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.06	■■■■■ 4.32
LMAN2-208	ENST00000515209	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.03	■■■■■ 4.32
LMAN2-208	ENST00000515209	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LMAN2-208	ENST00000515209	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LMAN2-208	ENST00000515209	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.93	■■■■■ 4.3	6e-7	■■■■□ 21.3
LMAN2-208	ENST00000515209	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.84	■■■■■ 4.29
LMAN2-208	ENST00000515209	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.81	■■■■■ 4.28
LMAN2-208	ENST00000515209	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.75	■■■■■ 4.27
LMAN2-208	ENST00000515209	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.7	■■■■■ 4.27
LMAN2-208	ENST00000515209	CHD1	O14646	1710 aa		41.64	■■■■■ 4.26
LMAN2-208	ENST00000515209	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.64	■■■■■ 4.26
LMAN2-208	ENST00000515209	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.63	■■■■■ 4.25
LMAN2-208	ENST00000515209	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.59	■■■■■ 4.25
LMAN2-208	ENST00000515209	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.57	■■■■■ 4.25
LMAN2-208	ENST00000515209	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.55	■■■■■ 4.24
LMAN2-208	ENST00000515209	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.39	■■■■■ 4.22
LMAN2-208	ENST00000515209	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.35	■■■■■ 4.21
LMAN2-208	ENST00000515209	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.33	■■■■■ 4.21
LMAN2-208	ENST00000515209	FBLN2	P98095	1184 aa		41.27	■■■■■ 4.2
LMAN2-208	ENST00000515209	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.21	■■■■■ 4.19
LMAN2-208	ENST00000515209	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.17	■■■■■ 4.18
LMAN2-208	ENST00000515209	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.15	■■■■■ 4.18
LMAN2-208	ENST00000515209	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.14	■■■■■ 4.18
LMAN2-208	ENST00000515209	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.13	■■■■■ 4.17
LMAN2-208	ENST00000515209	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.08	■■■■■ 4.17
LMAN2-208	ENST00000515209	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.08	■■■■■ 4.17
LMAN2-208	ENST00000515209	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.08	■■■■■ 4.17
LMAN2-208	ENST00000515209	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.03	■■■■■ 4.16
LMAN2-208	ENST00000515209	CUL7	Q14999	1698 aa		41.01	■■■■■ 4.16
LMAN2-208	ENST00000515209	IGF1R	P08069	1367 aa		40.98	■■■■■ 4.15
LMAN2-208	ENST00000515209	CEP170	Q5SW79	1584 aa		40.97	■■■■■ 4.15
LMAN2-208	ENST00000515209	NUP160	Q12769	1436 aa		40.96	■■■■■ 4.15
LMAN2-208	ENST00000515209	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.87	■■■■■ 4.13
LMAN2-208	ENST00000515209	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.78	■■■■■ 4.12
LMAN2-208	ENST00000515209	SHROOM2	Q13796	1616 aa		40.75	■■■■■ 4.11
LMAN2-208	ENST00000515209	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.71	■■■■■ 4.11
LMAN2-208	ENST00000515209	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.7	■■■■■ 4.11
LMAN2-208	ENST00000515209	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		40.56	■■■■■ 4.08
LMAN2-208	ENST00000515209	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		40.53	■■■■■ 4.08

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