Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FFAR3O14843 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FFAR3O14843 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FFAR3O14843 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FFAR3O14843 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FFAR3O14843 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FFAR3O14843 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FFAR3O14843 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FFAR3O14843 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FFAR3O14843 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FFAR3O14843 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FFAR3O14843 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms