Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL33A6NCF5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL33A6NCF5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL33A6NCF5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms