Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DDB1-207ENST00000535967 1404 ntTSL 313.3□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDE1-209ENST00000574109 843 ntTSL 313.19□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-204ENST00000586108 575 ntTSL 312.99□□□□□ -0.334e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DDX39B-210ENST00000431908 914 ntTSL 512.9□□□□□ -0.347e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TRA2B-213ENST00000485530 839 ntTSL 212.84□□□□□ -0.354e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 PMPCA-205ENST00000462616 3341 ntTSL 212.59□□□□□ -0.394e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-221ENST00000495016 286 ntTSL 212.43□□□□□ -0.428e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DNMT1-207ENST00000586588 3094 ntTSL 212.39□□□□□ -0.434e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CCDC137-203ENST00000572531 265 ntTSL 312.37□□□□□ -0.434e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CPNE7-206ENST00000532500 550 ntTSL 312.1□□□□□ -0.474e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-215ENST00000591563 4382 ntTSL 212.08□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DNMT1-208ENST00000586667 714 ntTSL 212.01□□□□□ -0.494e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.57e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.597e-11■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 TRA2B-214ENST00000487615 4485 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.644e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.677e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DDX39B-219ENST00000481456 5158 ntTSL 210.84□□□□□ -0.677e-11■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.794e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.794e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 56.86□□□□□ -1.314e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.424e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.494e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 PICALM-211ENST00000529016 757 ntTSL 34.63□□□□□ -1.674e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TRA2B-215ENST00000492417 4141 ntTSL 1 (best)4.18□□□□□ -1.744e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.754e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 53.38□□□□□ -1.875e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.155e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HSPD1-214ENST00000491249 860 ntTSL 26.95□□□□□ -1.33e-7■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 DCTN2-207ENST00000547345 566 ntTSL 26.62□□□□□ -1.354e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-224ENST00000511473 1150 ntTSL 510.62□□□□□ -0.711e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.711e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-221ENST00000509148 888 ntTSL 210.61□□□□□ -0.711e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-219ENST00000508682 1208 ntTSL 510.37□□□□□ -0.751e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-228ENST00000512968 1058 ntTSL 510.22□□□□□ -0.771e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 510□□□□□ -0.811e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-222ENST00000509535 456 ntTSL 310□□□□□ -0.811e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-233ENST00000514455 791 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 39.21□□□□□ -0.941e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-210ENST00000504325 1098 ntTSL 1 (best)9.19□□□□□ -0.941e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -11e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-209ENST00000504128 990 ntTSL 28.66□□□□□ -1.021e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MATR3-220ENST00000512876 575 ntTSL 317.87■□□□□ 0.458e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MATR3-210ENST00000504643 2560 ntTSL 28.49□□□□□ -1.058e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MATR3-218ENST00000511978 573 ntTSL 36.42□□□□□ -1.388e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MATR3-226ENST00000515833 1001 ntTSL 55.71□□□□□ -1.58e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MATR3-216ENST00000511249 447 ntTSL 45.51□□□□□ -1.538e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MATR3-214ENST00000509918 377 ntTSL 44.78□□□□□ -1.648e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RACK1-216ENST00000507273 358 ntTSL 28.66□□□□□ -1.023e-42■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.375e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HMGN1-217ENST00000489072 1014 ntTSL 325.97■■□□□ 1.753e-25■□□□□ 8.5
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