Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THUMPD1Q9NXG2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD1Q9NXG2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THUMPD1Q9NXG2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THUMPD1Q9NXG2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD1Q9NXG2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms