Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX1Q9NSU2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX1Q9NSU2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX1Q9NSU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX1Q9NSU2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX1Q9NSU2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TREX1Q9NSU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TREX1Q9NSU2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREX1Q9NSU2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREX1Q9NSU2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms