Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LPIN3Q9BQK8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LPIN3Q9BQK8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPIN3Q9BQK8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LPIN3Q9BQK8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPIN3Q9BQK8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms