Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIGSQ96S52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIGSQ96S52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIGSQ96S52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIGSQ96S52 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIGSQ96S52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms