Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINGO1Q96FE5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINGO1Q96FE5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINGO1Q96FE5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINGO1Q96FE5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINGO1Q96FE5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINGO1Q96FE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO1Q96FE5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINGO1Q96FE5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO1Q96FE5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms