Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHFRQ96EP1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHFRQ96EP1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHFRQ96EP1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHFRQ96EP1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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