RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414510.5

PTPA-210, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPA, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-210ENST00000414510 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.59■■■■■ 7.13
PTPA-210ENST00000414510 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.07■■■■■ 6.09
PTPA-210ENST00000414510 ABCC9O60706 1549 aa52.09■■■■■ 5.93
PTPA-210ENST00000414510 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.99■■■■■ 5.59
PTPA-210ENST00000414510 NACADO15069 1562 aa49.87■■■■■ 5.57
PTPA-210ENST00000414510 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.81■■■■■ 5.56
PTPA-210ENST00000414510 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.64■■■■■ 5.54
PTPA-210ENST00000414510 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.47■■■■■ 5.51
PTPA-210ENST00000414510 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.24■■■■■ 5.47
PTPA-210ENST00000414510 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.02■■■■■ 5.44
PTPA-210ENST00000414510 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.61■■■■■ 5.37
PTPA-210ENST00000414510 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.56■■■■■ 5.36
PTPA-210ENST00000414510 SCRIBQ14160 1630 aa48.5■■■■■ 5.36
PTPA-210ENST00000414510 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.89■■■■■ 5.26
PTPA-210ENST00000414510 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.87■■■■■ 5.25
PTPA-210ENST00000414510 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
PTPA-210ENST00000414510 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.12■■■■■ 5.13
PTPA-210ENST00000414510 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.76■■■■■ 5.08
PTPA-210ENST00000414510 SMARCA4P51532 1647 aa46.33■■■■■ 5.01
PTPA-210ENST00000414510 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.99
PTPA-210ENST00000414510 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.05■■■■■ 4.96
PTPA-210ENST00000414510 NCAPD3P42695 1498 aa45.99■■■■■ 4.95
PTPA-210ENST00000414510 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.98■■■■■ 4.95
PTPA-210ENST00000414510 SMARCA2P51531 1590 aa45.96■■■■■ 4.95
PTPA-210ENST00000414510 HMGXB3Q12766 1538 aa45.82■■■■■ 4.92
PTPA-210ENST00000414510 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.81■■■■■ 4.92
PTPA-210ENST00000414510 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
PTPA-210ENST00000414510 WIZO95785 1651 aa45.53■■■■■ 4.88
PTPA-210ENST00000414510 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
PTPA-210ENST00000414510 NESP48681 1621 aa45.07■■■■■ 4.81
PTPA-210ENST00000414510 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
PTPA-210ENST00000414510 ERCC6Q03468 1493 aa44.85■■■■■ 4.77
PTPA-210ENST00000414510 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.85■■■■■ 4.77
PTPA-210ENST00000414510 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.64■■■■■ 4.74
PTPA-210ENST00000414510 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.58■■■■■ 4.73
PTPA-210ENST00000414510 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.48■■■■■ 4.71
PTPA-210ENST00000414510 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
PTPA-210ENST00000414510 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.42■■■■■ 4.7
PTPA-210ENST00000414510 CUX2O14529 1486 aa44.4■■■■■ 4.7
PTPA-210ENST00000414510 CFTRP13569 1480 aa44.38■■■■■ 4.69
PTPA-210ENST00000414510 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.2■■■■■ 4.67
PTPA-210ENST00000414510 PRDM2Q13029 1718 aa44.17■■■■■ 4.66
PTPA-210ENST00000414510 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.15■■■■■ 4.66
PTPA-210ENST00000414510 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.12■■■■■ 4.65
PTPA-210ENST00000414510 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
PTPA-210ENST00000414510 WDR62O43379 1518 aa43.99■■■■■ 4.63
PTPA-210ENST00000414510 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
PTPA-210ENST00000414510 TOPBP1Q92547 1522 aa43.49■■■■■ 4.55
PTPA-210ENST00000414510 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.43■■■■■ 4.54
PTPA-210ENST00000414510 ABCC8Q09428 1581 aa43.36■■■■■ 4.53
PTPA-210ENST00000414510 IFT140Q96RY7 1462 aa43.19■■■■■ 4.51
PTPA-210ENST00000414510 CUX1P39880 1505 aa43.15■■■■■ 4.5
PTPA-210ENST00000414510 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.13■■■■■ 4.49
PTPA-210ENST00000414510 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
PTPA-210ENST00000414510 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
PTPA-210ENST00000414510 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
PTPA-210ENST00000414510 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43■■■■■ 4.47
PTPA-210ENST00000414510 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.96■■■■■ 4.47
PTPA-210ENST00000414510 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
PTPA-210ENST00000414510 SOGA1O94964 1423 aa42.88■■■■■ 4.45
PTPA-210ENST00000414510 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.81■■■■■ 4.443e-7■■■■■ 30.5
PTPA-210ENST00000414510 SYNJ1O43426 1573 aa42.77■■■■■ 4.44
PTPA-210ENST00000414510 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.76■■■■■ 4.441e-6■■□□□ 12
PTPA-210ENST00000414510 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.75■■■■■ 4.43
PTPA-210ENST00000414510 WDR97A6NE52 1622 aa42.74■■■■■ 4.43
PTPA-210ENST00000414510 TOP2BQ02880 1626 aa42.71■■■■■ 4.43
PTPA-210ENST00000414510 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
PTPA-210ENST00000414510 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.54■■■■■ 4.4
PTPA-210ENST00000414510 CHD1O14646 1710 aa42.48■■■■■ 4.39
PTPA-210ENST00000414510 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.46■■■■■ 4.39
PTPA-210ENST00000414510 PBRM1Q86U86 1689 aa42.45■■■■■ 4.39
PTPA-210ENST00000414510 OSCARQ8IYS5 282 aa42.45■■■■■ 4.39
PTPA-210ENST00000414510 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.43■■■■■ 4.38
PTPA-210ENST00000414510 GRIN2BQ13224 1484 aa42.4■■■■■ 4.38
PTPA-210ENST00000414510 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.4■■■■■ 4.38
PTPA-210ENST00000414510 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PTPA-210ENST00000414510 FBLN2P98095 1184 aa42.27■■■■■ 4.36
PTPA-210ENST00000414510 SYNJ2O15056 1496 aa42.15■■■■■ 4.34
PTPA-210ENST00000414510 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
PTPA-210ENST00000414510 ADAMTS12P58397 1594 aa42.07■■■■■ 4.33
PTPA-210ENST00000414510 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.01■■■■■ 4.32
PTPA-210ENST00000414510 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
PTPA-210ENST00000414510 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
PTPA-210ENST00000414510 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.98■■■■■ 4.31
PTPA-210ENST00000414510 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.95■■■■■ 4.31
PTPA-210ENST00000414510 ARHGEF11O15085 1522 aa41.91■■■■■ 4.3
PTPA-210ENST00000414510 GRIN2AQ12879 1464 aa41.89■■■■■ 4.3
PTPA-210ENST00000414510 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.88■■■■■ 4.3
PTPA-210ENST00000414510 KIF27Q86VH2 1401 aa41.83■■■■■ 4.29
PTPA-210ENST00000414510 TRIM41Q8WV44 630 aa41.76■■■■■ 4.28
PTPA-210ENST00000414510 CEP170Q5SW79 1584 aa41.76■■■■■ 4.27
PTPA-210ENST00000414510 NUP160Q12769 1436 aa41.69■■■■■ 4.27
PTPA-210ENST00000414510 IGF1RP08069 1367 aa41.68■■■■■ 4.26
PTPA-210ENST00000414510 CUL7Q14999 1698 aa41.65■■■■■ 4.26
PTPA-210ENST00000414510 ARAP1Q96P48 1450 aa41.59■■■■■ 4.25
PTPA-210ENST00000414510 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.54■■■■■ 4.24
PTPA-210ENST00000414510 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.45■■■■■ 4.23
PTPA-210ENST00000414510 SHROOM2Q13796 1616 aa41.44■■■■■ 4.22
PTPA-210ENST00000414510 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.44■■■■■ 4.22
PTPA-210ENST00000414510 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.42■■■■■ 4.22
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