Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHDC3Q96DC8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHDC3Q96DC8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHDC3Q96DC8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
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