Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KBTBD3Q8NAB2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KBTBD3Q8NAB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KBTBD3Q8NAB2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KBTBD3Q8NAB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms