Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDDC3Q8N4P3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDDC3Q8N4P3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC3Q8N4P3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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