Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KSR1Q8IVT5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KSR1Q8IVT5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KSR1Q8IVT5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms