Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC39A4Q6P5W5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC39A4Q6P5W5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC39A4Q6P5W5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC39A4Q6P5W5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC39A4Q6P5W5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC39A4Q6P5W5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms