Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC142Q17RM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC142Q17RM4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC142Q17RM4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC142Q17RM4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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