Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC1Q15915 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC1Q15915 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC1Q15915 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms