Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN1Q12860 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN1Q12860 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN1Q12860 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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