Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRB3Q04118 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB3Q04118 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRB3Q04118 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRB3Q04118 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms