Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFBR3Q03167 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGFBR3Q03167 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGFBR3Q03167 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR3Q03167 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms