Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPL7AP62424 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL7AP62424 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL7AP62424 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL7AP62424 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms