Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARF3P61204 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARF3P61204 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARF3P61204 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARF3P61204 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARF3P61204 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARF3P61204 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARF3P61204 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARF3P61204 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARF3P61204 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARF3P61204 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARF3P61204 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARF3P61204 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARF3P61204 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARF3P61204 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARF3P61204 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARF3P61204 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARF3P61204 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARF3P61204 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARF3P61204 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARF3P61204 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARF3P61204 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARF3P61204 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARF3P61204 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARF3P61204 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARF3P61204 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARF3P61204 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARF3P61204 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARF3P61204 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARF3P61204 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARF3P61204 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARF3P61204 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARF3P61204 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARF3P61204 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARF3P61204 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARF3P61204 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARF3P61204 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARF3P61204 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARF3P61204 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARF3P61204 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARF3P61204 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARF3P61204 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARF3P61204 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARF3P61204 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARF3P61204 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARF3P61204 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARF3P61204 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF3P61204 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF3P61204 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF3P61204 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF3P61204 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF3P61204 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF3P61204 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF3P61204 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF3P61204 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF3P61204 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF3P61204 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF3P61204 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF3P61204 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF3P61204 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF3P61204 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF3P61204 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF3P61204 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF3P61204 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF3P61204 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF3P61204 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF3P61204 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF3P61204 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF3P61204 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF3P61204 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF3P61204 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF3P61204 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF3P61204 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF3P61204 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF3P61204 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF3P61204 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF3P61204 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF3P61204 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF3P61204 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF3P61204 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF3P61204 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF3P61204 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARF3P61204 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARF3P61204 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARF3P61204 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARF3P61204 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARF3P61204 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARF3P61204 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARF3P61204 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARF3P61204 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARF3P61204 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARF3P61204 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARF3P61204 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARF3P61204 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARF3P61204 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARF3P61204 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARF3P61204 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARF3P61204 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARF3P61204 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARF3P61204 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms