Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
NCKAP1LP55160 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCKAP1LP55160 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCKAP1LP55160 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCKAP1LP55160 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCKAP1LP55160 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms