Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTF4P34130 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NTF4P34130 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTF4P34130 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTF4P34130 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTF4P34130 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTF4P34130 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTF4P34130 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTF4P34130 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTF4P34130 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTF4P34130 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTF4P34130 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTF4P34130 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTF4P34130 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTF4P34130 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTF4P34130 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTF4P34130 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTF4P34130 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTF4P34130 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTF4P34130 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTF4P34130 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTF4P34130 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTF4P34130 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTF4P34130 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTF4P34130 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTF4P34130 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTF4P34130 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTF4P34130 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTF4P34130 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTF4P34130 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTF4P34130 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTF4P34130 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTF4P34130 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTF4P34130 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTF4P34130 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTF4P34130 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTF4P34130 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF4P34130 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF4P34130 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF4P34130 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF4P34130 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF4P34130 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NTF4P34130 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTF4P34130 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTF4P34130 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTF4P34130 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NTF4P34130 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTF4P34130 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTF4P34130 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTF4P34130 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTF4P34130 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTF4P34130 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NTF4P34130 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTF4P34130 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTF4P34130 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NTF4P34130 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTF4P34130 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTF4P34130 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTF4P34130 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTF4P34130 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTF4P34130 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NTF4P34130 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTF4P34130 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTF4P34130 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTF4P34130 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTF4P34130 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NTF4P34130 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NTF4P34130 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NTF4P34130 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTF4P34130 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTF4P34130 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTF4P34130 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NTF4P34130 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF4P34130 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF4P34130 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF4P34130 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF4P34130 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF4P34130 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NTF4P34130 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTF4P34130 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NTF4P34130 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NTF4P34130 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NTF4P34130 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NTF4P34130 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NTF4P34130 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTF4P34130 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NTF4P34130 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTF4P34130 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTF4P34130 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NTF4P34130 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTF4P34130 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NTF4P34130 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms