Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMPK1P30085 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK1P30085 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CMPK1P30085 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK1P30085 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMPK1P30085 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMPK1P30085 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMPK1P30085 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMPK1P30085 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms