Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB5P28074 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB5P28074 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB5P28074 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms